- Tahun 2003 kasus pengeboman sejumlah wilayah di Indonesia.
- Bom di Mabes Polri pada 3 Februari.
- Bom di Bandara Soekarno-Hatta (terminal 2F) pada 27 April 2003.
- Bom di Hotel JW Marriott pada 5 Agustus.
- Tahun 2004 kasus pengeboman sejumlah wilayah di Indonesia.
- Bom di Palopo, Sulawesi pada 10 Januari.
- Bom di Kedutaan Besar Australia pada 9 September.
- Bom di Gereja Immanuel, Palu, Sulawesi pada 12 Desember.
- Tahun 2005 kasus pengeboman sejumlah wilayah di Indonesia.
- Bom di Ambon pada 21 Maret.
- Bom di Tentena, Sulawesi pada 28 Mei.
- Bom di Pamulang pada 8 Juni.
- Bom di Bali pada 1 Oktober.
- Bom di Pasar Palu pada 31 Desember.
- Tahun 2009 kasus bom di Hotel JW Marriott dan Ritz-Carlton pada 17 Juli.
- Tahun 2010 kasus penembakan dan warga sipil terjadi di Aceh pada Januari.
- Tahun 2011 kasus pengeboman dan teror bom sejumlah wilayah di Indonesia.
- Teror bom buku di bulan Maret.
- Bom di Masjid Mapolresta Cirebon pada 15 April.
- Bom di Gereja Christ Cathedral Serpong pada 22 April.
- Bom di GBIS Kepunton Solo pada 25 September.
- Tahun 2012 kasus bom di Pospam Gladak, Soli pada 19 Agustus.
- Tahun 2013 kasus bom di Masjid Mapolres Poso pada 9 Juni.
- Tahun 2016 kasus pengeboman sejumlah wilayah di Indonesia.
- Bom dan baku tembak di sekitar Plaza Sarinah pada 14 Januari.
- Bom bunuh diri di Markas Kepolisian Resor Kota Surakarta pada 5 Juni.
- Bom bunuh diri di Gereja Katolik Stasi Santo Yosep, Kota Medan pada 28 Agustus.
- Bom di Gereja Oikumene Samarinda pada 13 November.
- Bom di Vihara Budi Dharma Singkawang 14 November